无花果苗天然变异和杂交育种（包含实生苗选育）是无花果育种的主要途径。天然变异一般变异性状规模较窄，而杂交育种（包含实生苗选育）的子孙发生的变化更广泛，得到的新种类具有更大的价值。

我国无花果种类绝大多数引自国外，现在被官方确定的国内自育种类仅一两个。主要原因是无花果育种难度很大。

第一个原因：无花果不像桃树或苹果等果树那样简单芽变，无花果变异很少，被发现且有利用价值的更少之又少；

第二个原因：

1、无花果实生苗，即用种子培育的无花果苗，需求多年才干成果，有的底子就不成果

2、能成果的，绝大多数需求授粉，不适合我国栽培；

3、成果后不需求授粉的，大多严峻劣变，很少能得到有价值的新种类。由于无花果实生苗挑选育种成功率极低，加之周期太长，投入极大，无花果杂交育种和实生苗选种，在我国很难获得国家项目支撑，国内尚无官方支撑的相关研究课题。

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